Az EU Ökorendelete a bioélelmiszerek esetében szűk határok közé szorítja az élelmiszer-adalékanyagok használatát. Az Európai Unióban engedélyezett több mint 300 adalékanyag közül csupán néhány használható fel ökológiai élelmiszerek előállításához.

Színezékek, édesítőszerek, stabilizátorok és ízfokozók egyáltalán nem alkalmazhatók. Emellett a biotermékekben csak abban az esetben engedélyezett az élelmiszer-adalékanyagok használata, ha az adott termék ezen anyagok nélkül nem állítható elő, és nem tartósítható.

Az Európai Unióban illetve a biocímke elnyeréséhez az EU Ökorendeletének előírásai mérvadóak. Az ökológiai gazdálkodók szervezeteinek ajánlásai azonban ezeknél gyakran szigorúbbak.

Az alábbiakban felsorolt adalékanyagok használata engedélyezett bioélelmiszerek esetében is. A pont (•) azokat az anyagokat jelöli, amelyek az ökológiai gazdálkodók szervezeteinek ajánlásai alapján is alkalmazhatók:
E 170 Kálcium-karbonát (•)
E 270 Tejsav (•)
E 290 Szén-dioxid (•)
E 296 Almasav (•)
E 300 Aszkorbinsav (•)
E 306 Tokoferoltartalmú természetes kivonatok
E 322 Lecitin (•)
E 330 Citromsav (•)
E 333 Kalcium-citrátok (•)
E 334 Borkősav (•)
E 335 Nátrium-tartarátok (•)
E 336 Kálium-tartarátok (•)
E 341 i) Monokálcium-foszfát
E 400 Alginsav
E 401 Nátrium-alginát
E 402 Kálium-alginát
E 406 Agar-agar (•)
E 407 Karragén
E 410 Szentjánoskenyérmag-liszt (•)
E 412 Guármagliszt (•)
E 413 Tragantmézga
E 414 Gumiarábikum
E 415 Xantán
E 416 Karayagumi
E 422 Glicerin
E 440 i) Pektin (•)
E 500 Nátrium-karbonátok (•)
E 501 Kálium-karbonátok (•)
E 503 Ammónium-karbonátok (•)
E 504 Magnézium-karbonátok (•)
E 516 Kalcium-szulfát
E 524 Nátrium-hidroxid (•)
E 551 Szilícium-dioxid
E 938 Argon
E 941 Nitrogén (•)
E 948 Oxigén (•)

Az EU Ökorendelete az állati eredetű termékek feldolgozásával és a borkészítéssel kapcsolatban mindeddig nem foglalt állást. Az állati termékek esetében ez 2007. december 1-jéig fog megtörténni, addig a törvényi hiányosságokat a gazdaszervezetek saját szabályozásaikkal pótolják.

Ezek a hús valamint a bor esetében a következő adalékanyagok alkalmazását engedélyezik:
• Hús: E 325, 326, 327 (nátrium-, kálium- és kalciumlaktát)
• Bor, méhsör, mézbor: E 220 (kén-dioxid)

A bioélelmiszerek feldolgozásánál segédanyagként a következő anyagok is engedélyezettek: E 513 (kénsav), E 553b (talkum), E 558 (bentonit), E 901 (fehér és sárga méhviasz), E 903 (karnauba viasz). Mint a technológiai segédanyagokat általában, ezeket sem kell feltüntetni a csomagoláson, ennek ellenére egyes esetekben néhány biotermelő ezeket az anyagokat is megjelöli a címkén.